Nakon što su znanstvenici testirali njegove ostatke iz grobnice u kapelici Medici u Firenci, tvrde da mogu dokazati suprotno.
Dugo se sumnjalo da su Francesco de Medici i njegova žena bili otrovani. Sada, koristeći modernu toksikologijsku i forenzičku opremu znanstvenici vjeruju da mogu dokazati da su supružnici Medici primili smrtonosnu dozu arsena.
Znanstvenica Donatella Lippi tvrdi da uzorci Francescove jetre pokazuju razinu arsena koja je znatno veća od normalne.
"Činjenica da su preživjeli 11 dana nakon što su se razbolili je zato što je doza arsena bila smrtonosna, ali ne dovoljno visoka kako ne bi izazvala sumnje"
Neki vjeruju da ga je ubio njegov brat kardinal Ferdinando de Medici koji je želio moć. Čak se govori da je njegovo ponašanje u vrijeme smrti bilo sumnjivo.
Postoji još jedna priča prema kojoj je ubojstvo počinila njegova supruga Bianca.
"Bianca je spremila otrovanu hranu za Ferdinanda koji je nije htio pojesti, a neočekivano ju je pojeo Francesco", rekla je Donatella Lippi, "u očaju, Bianca je namjerno slijedila sudbinu svoga muža".
