Nadbiskup Wielgus je zanijekao optužbe: "Nisam izvršavo tajne zadatke. Nikada nikome nisam nanio zlo", te napomenuo da su dokumente koji sugeriraju drugačije sastavili komunistički "funkcionari".
Poljski pučki pravobranitelj Janusz Kochanowski je rekao da dokumenti koje je on pregledao ukazuju da je nadbiskup Wielgus surađivao s tajnom službom Sluzba Bezpieczenstwa 1970-ih. Odbor istražitelja Crkve je rekao: "Postoje mnogobrojni, relevantni dokumenti koji pokazuju da je Stanislaw Wielgus bio spreman savjesno i tajno surađivati s komunističkim sigurnosnim službama, te da je započeo takvu suradnju."
Ova otkrića su potaknula poziv na njegovu ostavku.
No, usprkos optužbama, koje su se u poljskom tisku prvi put pojavile 20. prosinca, dva tjedna nakon što je Wielgus imenovan nadbiskupom, iz Vatikana su objavili da on ima njihovu potporu. "Sveta je stolica tijekom odlučivanja o imenovanju novog varšavskog nadbiskupa uzela u obzir sve okolnosti iz njegovog života, uključujući i one iz prošlosti", stoji u priopćenju Vatikana.
Smatra se da je u Poljskoj komunistička vlast bila posebno zainteresirana za infiltraciju u Katoličku crkvu jer su je smatrali središtem otpora. Crkva je u poljskom društvu odigrala vodeću ulogu u borbi protiv komunizma, naročito za vrijeme pape Pavla Ivana II.