Najavljujući datum odlaska, Ahern je izjavio kako "interes irskog naroda te stranke Fianna Fail stavlja ispred vlastitih interesa".
Istaknuo je kako je njegov odlazak osobne prirode, a temelji se na osobnoj želji da okonča situaciju u kojoj je posao vlade neprestano ometan skretanjem pozornosti na njegov njegov način života i pitanje eventualnih financijskih nepravilnosti koje se povezuju s njegovim imenom.
Devedesetih godina Ahern je optužen za korupciju u skandalu koji je izbio zbog sumnji da je primao novac od građevinskog poduzetnika Owena O'Calaghana u zamjenu za usluge, među kojima osobito pomoć u prenamjeni poljoprivrednog u građevinsko zemljište.
Odgovarajući u rujnu 1997. pred antikorupcijskim sudom Ahern je kazao kako potpuno odbacuje navode o nezakonitom postupanju.
"Od njega (O'Callaghana) nikad nisam dobio ni čašu vode, a kamoli novac", rekao je tada Ahern pred antikorupcijskim sudom. Nakon javnih saslušanja istraga je zbog nedostatka dokaza obustavljena.
Irski tisak tada je cijelu aferu oko navodne Ahernove umiješanosti u korupciju prozvao "Bertiegate".
Unatoč svemu, 2007. Bertie Ahern osvojio je treći uzastopni premijerski mandat.