'Za ministarstvo pravosuđa stvar je svršena', priopćio je ured tužitelja, potvrdivši informacije portugalskih glasila. Dnevnik Publico pisao je početkom lipnja da je državno tužiteljstvo zatvorilo istragu, zaključivši da su zrakoplovi CIA-e doista prelijetali portugalski teritorij, ali ne mogavši potvrditi da su zatvorenici vezanih ruku viđeni na uzletištima portugalskih zračnih luka.
U veljači 2007. portugalsko pravosuđe je počelo istragu o možebitnim letovima zrakoplova koji su tajno, za račun CIA-e, prevozili zatočenike u američki logor Guantanamo koristeći portugalski zračni prostor. Portugalska vlada je u više navrata izjavljivala da je provodila istragu o tome jesu li zrakoplovi CIA-e u tom razdoblju koristili njezin zračni prostor, ali da nije pronašla nikakav dokaz koji bi upućivao na protuzakonitost.
Europski parlament koji je također istraživao o tom pitanju, zatražio je 2006. od Portugala da nastavi istragu. Izvješće istražnog povjerenstva parlamenta pokazalo je da je u europskom zračnom prostoru bilo najmanje 1245 letova zrakoplove koje je unajmila CIA. U tom se izvješću spominju imena 14 zemalja. (Hina)