Predsjednik Stjepan Mesić i premijer Ivica Račan poslije 2000. godine počeli su sa stvaranjem političkih uvjeta za obračun s organiziranim kriminalom koji je bio prisutan u samom državnom vrhu, što izlazi na vidjelo u slučaju umirovljenoga generala Vladimira Zagorca.
Analiza zloporaba
Ovo je navedeno u analizi o organiziranom kriminalu i ulozi Vladimira Zagorca, koju je 'Slobodna Dalmacija' dobila iz visokopozicioniranih izvora.
U tom dokumentu se ističe da je Zagorec u svojoj nezasitnosti za novcem radio iza leđa i ministru obrane Gojku Šušku, inače generalovu zaštitniku s neograničenom vlašću u MORH-u i sukreatoru glavnih državnih odluka.
Također se naglašava da su SIS i Kriminalistička vojna policija u odnosu na Zagorca i još nekoliko Šuškovih pomoćnika bili fikusi.
Izrijekom se navodi da su SIS i SZUP bili u funkciji generalovih aktivnosti, uključujući i kriminal za osobnu korist.
Osim u javnosti već poznate lažne Zagorčeve putovnice na ime Franje Rudelića, navodi se da je umirovljeni general dobio još dva kompleta lažnih isprava.
Na ime Zvonimir Majdak izdana mu je putovnica broj 08027026, vozačka dozvola 9177527 i osobna iskaznica 9090514, te na ime Stjepan Kotarski putovnica broj 08027025, vozačka dozvola 9177526 i osobna iskaznica 0900513.
Da Zagorčevi poslovi nabave oružja, s debelom provizijom, ne bi izazvali ni najmanju sumnju drugih Šuškovih pomoćnika, on je kao najutjecajniji bio široke ruke prema njima, posebice prema Markici Rebiću, Marinku Krešiću, Anti Gugiću i Ivanu Tolju, omogućujući im dobivanje stanova, kredita, kreditne kartice i druge beneficije za lagodan život.
U analizi se spominje podatak da je jedan od trojice prethodno spomenutih pomoćnika u nepuna tri mjeseca kreditnomkarticom, koju mu je izdao Zagorec, na reprezentaciju potrošio 200 tisuća kuna.
Na kraju se navodi da je Zagorec, odlaskom iz Ministarstva obrane i tvrtke 'RH Alan', detaljno počistio sve tragove svojih zlodjela.
Međutim, zaključuje se, zajedničkim radom Državnog odvjetništva, Ravnateljstva policije, VSOA-e i SOA-e otkriveni su dokumenti iz kojih proizlazi da je Zagorec zajedno s bliskim osobama oštetio proračun za više stotina milijuna kuna.