Šeks je svjedočenje u velikoj sudnici zagrebačkog Županijskog suda počeo prisjećanjem kako se organizirala obrana Osijeka i područja za koje je kao šef regionalnog Kriznog stožera bio zadužen nekoliko mjeseci 1991. Nakon ukidanja štaba na tom je području ostao kao Vladin povjerenik.
Izjavio je da je vojni zapovjednik Kriznog štaba bio Franjo Pejić, a članovi Ivan Petrinović, Eduard Bakarac, koji su bili zaduženi za vojne postrojbe te Tomislav Merčep, Stjepan Galović i Branimir Glavaš koji su, kazao je, bili skupina vezana za civilne funkcije. Šeks je posvjedočio da je Glavaš početkom studenoga 1991. imenovan pomoćnikom zapovjednika obrane Slavonije i Baranje Karla Gorinšeka, a početkom prosinca zapovjednikom grada Osijeka. Šeksovo svjedočenje došlo je pratiti i nekoliko Glavaševih stranačkih kolega iz HDSSB-a.
Glavaš naime tvrdi da je u napadnutom Osijeku Šeks bio 'bog i batina', bez čijeg se znanja ništa nije moglo dogoditi. Šeks bi na prijedlog obrane trebao svjedočiti o organiziranju obrane u Osijeku 1991. i navodnim odvođenjima i likvidacijama srpskih civila. Šeks je, naime, nekoliko mjeseci u Osijeku bio predsjednik regionalnoga Kriznog stožera, a nakon njegova ukinuća i Vladin povjerenik.
Bivšeg suradnika i stranačkog kolegu Glavaš je prozvao krajem 2007., iznoseći svoju obranu na početku suđenja za ratne zločine nad srpskim civilima. 'Ništa se nije moglo dogoditi bez znanja, suglasnosti i odobrenja čelnog čovjeka regionalnoga Kriznog stožera. To ne govorim da bih na nekoga prenio odgovornost, nego iznosim činjenice iz tog vremena', rekao je tada prvooptuženi Glavaš, ističući kako nitko ne bi mogao povjerovati da je on zapovijedao Šeksu.
Glavaševe tvrdnje Šeks nije želio komentirati, nego je rekao da je u tijeku kazneni postupak te da bi se svaka njegova riječ mogla protumačiti na način koji nije u skladu s ulogom sudske vlasti. Odbacivši tvrdnje da je postupak politički motiviran rekao je da nema nikakvih informacija o Glavaševoj navodnoj povezanosti s likvidacijama osječkih Srba te da vjeruje u njegovu nevinost. Glavaš i Šeks, dugogodišnji prijetelji i politički suradnici, razišli su se nakon Glavaševa isključenja iz HDZ-a u proljeće 2005.
Šeksovo svjedočenje već je bilo najavljeno za 19. siječnja ali je tada odgođeno zbog bolesti Glavaša.
Inače, na jučerašnjoj glavnoj raspravi svoje dvodnevno svjedočenje iza zatvorenih vrata završio je zaštićeni svjedok "Drava", nakon čega je saslušan i bivši pripadnik Samostalne uskočke satnije (SUS) Zoran Sever Smrček koji nije teretio nikog od šestero optuženih za ratne zločine nad srpskim civilima u Osijeku 1991. Svjedok je rekao da, osim Ivice Krnjaka, nikog od optuženih nije poznavao niti zna koje su dužnosti obnašali.