Ističe da je zadaća Agencije pomoći u izgradnju modela kvalitete u zdravstvu prema najboljim suvremenim spoznajama, pridonijeti osiguranju uvjeta za najbolji mogući povoljan ishod liječenja te smanjenje rizika za nastanak neželjenih posljedica po zdravlje ljudi.
Agencija će se, među ostalim, baviti stimulativnim mjerama za najkvalitetnije u sustavu, procjenom kvalitete opreme, terapijskim postupcima, medicinskim proizvodima te provedbom antikorupcijskog programa, navodi se u priopćenju.