Neke od nepravilnosti u radu koje se odnose na nezakonito trošenje sredstava, sklapanje štetnih ugovora i lažiranje poslovnih bilanci anonimno su prijavili radnici. Tvrde da se Uprava HEP-a koristila knjigovodstvenim trikovima kako bi se rezultati poslovanja za prošlu godinu prikazali pozitivnima.
U HEP-u optužbe demantiraju i tvrde da su svi dokumenti na raspolaganju državnoj reviziji i nezavisnoj revizorskoj kući koja ih trenutačno obrađuje. Ništa spornoga nema ni za nadzorni odbor. 'Mi u nadzornom odboru nismo nikad vidjeli nekakve malverzacije u istragama i naravno sve radnje HEP-a se periodički analiziraju i svake godine revizorska kuća provodi određene analize i nikad te analize nisu pokazale određene malverzacije u poslovanju HEP-a', tvrdi predsjednik Nadzornog odbora HEP-a Leo Begović.